Euler applications and libraries

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Introduction

On Euler cluster, we plan to switch to LMOD modules, which provide some additional features compared to environment modules that we are currently using on Euler. LMOD allows to define a hierarchy of modules containing 3 layers (Core, Compiler, MPI). Therefore we present the list of available applications and libraries in a different way that takes into account the 3 layers of the module hierarchy.

Module hierarchy

Core layer

The core layer contains all module files which are not depending on any compiler/MPI. This can for instance be compilers, utility modules (eth_proxy, StdEnv) or commercial codes that bring their own runtime libraries to be independent of the compilers available on the system.

  • StdEnv
  • adf/2016.07
  • ansys/18.2
  • ansys/19.5
  • cfx/18.2
  • cfx/19.5
  • comsol/5.3a
  • comsol/5.4
  • eth_proxy
  • fluent/18.2
  • fluent/19.5
  • freesurfer/6.0.0
  • gcc/4.8.2
  • gcc/4.8.5
  • gcc/5.4.0
  • gcc/6.3.0
  • gcc/7.3.0
  • gcc/8.2.0
  • icemcfd/18.2
  • icemcfd/19.5
  • intel/18.0.1
  • intel/2018.1
  • intel_tools/18.0.1
  • intel_tools/2018.1
  • maple/2016
  • mathematica/11.1.1
  • matlab/R2017b
  • matlab/9.3
  • pgi/15.1
  • turbomole/7.0.2_smp
  • turbomole/7.0.2
  • vmd/1.9.3

Compiler layer

The compiler layer contains all modules which are depending on a particular compilers, but not on any MPI library. The standard compiler for the new software stack on Euler is GCC 4.8.5, therefore most applications and libraries are available for this compiler. There are additional toolchains for GCC 6.3.0 (supports c++14 standard), GCC 8.2.0 (supports c++17 standard) and for Intel 18.0.1.

GCC 4.8.5

  • abseil-cpp/20190808
  • ack/2.22
  • alglib/3.11.0
  • alsa-lib/1.1.4.1
  • angsd/0.921
  • ant/1.9.9
  • antlr/2.7.7
  • apr-util/1.6.0
  • apr/1.6.2
  • aragorn/1.2.38
  • argtable/2-13
  • aspell/0.60.6.1
  • astral/4.10.7
  • astyle/3.0.1
  • atk/2.20.0
  • atk/2.21.90
  • atlas/3.10.2
  • atompaw/4.0.0.13
  • atop/2.2-3
  • autoconf/2.69
  • automake/1.15.1
  • bamtools/2.5.1
  • bamutil/1.0.13
  • bash/4.4.12
  • bazel/0.11.1
  • bazel/0.24.1
  • bbmap/37.36
  • bc/1.07
  • bcftools/1.6
  • bdw-gc/7.6.0
  • beast1/1.8.4
  • beast2/2.4.6
  • bedtools2/2.27.1
  • berkeley-db/6.2.32
  • binutils/2.28
  • binutils/2.29.1
  • bison/3.0.4
  • bitmap/1.0.8
  • blat/35
  • blaze/3.2
  • blitz/1.0.1
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • bowtie/1.2
  • bowtie2/2.3.4.1
  • bpp-core/2.2.0
  • bpp-phyl/2.2.0
  • bpp-seq/2.2.0
  • bpp-suite/2.2.0
  • bwa/0.7.17
  • bzip2/1.0.6
  • c-blosc/1.12.1
  • cairo/1.14.10
  • cairo/1.14.12
  • cap3/2015-02-11
  • cares/1.13.0
  • cdbfasta/2017-03-16
  • cdhit/4.6.8
  • cereal/1.2.2
  • cgal/4.11
  • cloc/1.74
  • clustalo/1.2.4
  • clustalw/2.1
  • cmake/2.8.10.2
  • cmake/3.5.2
  • cmake/3.9.4
  • cmake/3.11.0
  • cmake/3.11.1
  • cmake/3.15.3
  • cmocka/1.1.1
  • colm/0.12.0
  • compositeproto/0.4.2
  • connectome_workbench/1.3.2
  • coreutils/8.26
  • cppad/20170000.8
  • cppcheck/1.81
  • cppunit/1.13.2
  • cscope/15.8b
  • cube/4.3.5
  • cuda/9.1.85
  • cudnn/6.0
  • cups/2.2.3
  • curl/7.59.0
  • cvs/1.12.13
  • czmq/4.0.2
  • damageproto/1.2.1
  • dante/1.4.2
  • datamash/1.1.0
  • dbus/1.11.2
  • dmd/2.081.1
  • dmxproto/2.3.1
  • dos2unix/7.3.4
  • double-conversion/2.0.1
  • dri2proto/2.8
  • dri3proto/1.0
  • dropest/0.8.6
  • ed/1.4
  • eigen/3.3.4
  • elfutils/0.163
  • emacs/26.1
  • exonerate/2.4.0
  • expat/2.2.2
  • exuberant-ctags/5.8
  • farmhash/92e897
  • fastqc/0.11.5
  • fastx-toolkit/0.0.14
  • ffmpeg/3.2.4
  • fftw/3.3.5
  • findutils/4.6.0
  • fixesproto/5.0
  • flac/1.3.2
  • flash/1.2.11
  • flex/2.6.4
  • flint/2.5.2
  • fltk/1.3.3
  • fluidsynth/1.1.10
  • font-util/1.3.1
  • fontcacheproto/0.1.3
  • fontconfig/2.12.3
  • fontsproto/2.1.3
  • fonttosfnt/1.0.4
  • freetype/2.7.1
  • freexl/1.0.5
  • gatk/4.0.4.0
  • gawk/4.1.4
  • gdbm/1.14.1
  • gdk-pixbuf/2.31.2
  • gdk-pixbuf/2.31.3
  • gemmlowp/a6f29d9ac
  • geos/3.6.2
  • gettext/0.19.8.1
  • gflags/2.1.2
  • ghostscript-fonts/8.11
  • ghostscript/9.21
  • giflib/5.1.4
  • git-lfs/2.3.0
  • git/2.15.1
  • glew/2.0.0
  • glib/2.56.0
  • glm/0.9.7.1
  • global/6.5
  • glog/0.3.5
  • glpk/4.65
  • glproto/1.4.17
  • gmake/4.2.1
  • gmp/6.1.2
  • gnat/2016
  • gnuplot/5.2.0
  • gnutls/3.5.13
  • go-bootstrap/1.4-bootstrap-20171003
  • go/1.10.1
  • gobject-introspection/1.49.1
  • gobject-introspection/1.49.2
  • googletest/1.8.1
  • gperf/3.0.4
  • gperftools/2.4
  • graphtyper/1.3
  • groff/1.22.3
  • gsl/1.16
  • gsl/2.4
  • gtkplus/2.24.32
  • gts/121130
  • guile/2.2.0
  • harfbuzz/1.4.5
  • harfbuzz/1.4.6
  • harminv/1.4
  • hdf/4.2.13
  • hdf5/1.10.1
  • help2man/1.47.4
  • highfive/1.5
  • highwayhash/dfcb97
  • htop/2.0.2
  • htslib/1.6
  • htslib/1.7
  • hwloc/1.11.9
  • hwloc/2.0.1
  • hydra/3.3.1
  • hypre/2.13.0
  • icu4c/60.1
  • id3lib/3.8.3
  • image-magick/7.0.5-9
  • imake/1.0.7
  • inputproto/2.3.2
  • intel-tbb/2018.2
  • intltool/0.51.0
  • isl/0.14
  • isl/0.15
  • isl/0.19
  • jansson/2.9
  • jasper/1.900.1
  • jdk/8u141-b15
  • jemalloc/4.5.0
  • jmol/14.8.0
  • jq/1.5
  • jsoncpp/1.7.3
  • judy/1.0.5
  • kbproto/1.0.7
  • krb5/1.16.1
  • lcms/2.8
  • leveldb/1.20
  • lftp/4.8.1
  • libarchive/3.3.2
  • libatomic-ops/7.4.4
  • libbsd/0.8.6
  • libcerf/1.3
  • libcheck/0.12.0
  • libctl/3.2.2
  • libdrm/2.4.81
  • libdwarf/20160507
  • libedit/3.1-20170329
  • libelf/0.8.13
  • libevent/2.0.21
  • libfabric/1.8.0
  • libffi/3.2.1
  • libfontenc/1.1.3
  • libfs/1.0.7
  • libgcrypt/1.8.1
  • libgd/2.2.4
  • libgme/0.6.2
  • libgpg-error/1.27
  • libgpuarray/0.7.5
  • libgtextutils/0.7
  • libice/1.0.9
  • libiconv/1.15
  • libint/2.2.0
  • libjpeg-turbo/1.5.3
  • libjpeg/9c
  • libmng/2.0.3
  • libogg/1.3.2
  • libopenal/1.18.2
  • libpciaccess/0.13.5
  • libpipeline/1.4.2
  • libpng/1.6.34
  • libpthread-stubs/0.4
  • librdf/1.0.17
  • libsigsegv/2.11
  • libsm/1.2.2
  • libsndfile/1.0.28
  • libsodium/1.0.15
  • libsvm/322
  • libszip/2.1.1
  • libtiff/4.0.8
  • libtool/2.4.6
  • libunistring/0.9.7
  • libunwind/1.1
  • libvorbis/1.3.5
  • libx11/1.6.5
  • libxau/1.0.8
  • libxaw/1.0.13
  • libxc/2.2.2
  • libxc/3.0.0
  • libxcb/1.13
  • libxcomposite/0.4.4
  • libxdamage/1.1.4
  • libxdmcp/1.1.2
  • libxext/1.3.3
  • libxfixes/5.0.2
  • libxfont/1.5.2
  • libxft/2.3.2
  • libxi/1.7.6
  • libxinerama/1.1.3
  • libxkbcommon/0.8.0
  • libxkbfile/1.0.9
  • libxml2/2.9.4
  • libxmu/1.1.2
  • libxp/1.0.3
  • libxpm/3.5.12
  • libxrender/0.9.10
  • libxshmfence/1.2
  • libxslt/1.1.29
  • libxslt/1.1.30
  • libxsmm/1.13
  • libxt/1.1.5
  • libxv/1.0.10
  • libxvmc/1.0.9
  • llvm/5.0.1
  • llvm/6.0.0
  • lmdb/0.9.21
  • lmod/7.7.13
  • lua-luafilesystem/1_6_3
  • lua-luaposix/33.4.0
  • lua/5.3.4
  • lz4/1.8.1.2
  • lzip/1.19
  • lziprecover/1.19
  • lzlib/1.9
  • lzma/4.32.7
  • lzo/2.09
  • m4/1.4.18
  • mafft/7.221
  • man-db/2.7.6.1
  • maven/3.5.0
  • mawk/1.3.4
  • mesa-glu/9.0.0
  • mesa/17.2.3
  • metis/5.1.0
  • mkfontdir/1.0.7
  • mkfontscale/1.1.2
  • mono/5.4.1.7
  • mpc/1.1.0
  • mpfr/4.0.1
  • mpich/3.3.1
  • nasm/2.13.03
  • nco/4.6.7
  • ncurses/6.0
  • netcdf-cxx/4.2
  • netcdf/4.4.1.1
  • nettle/3.3
  • ninja/1.8.2
  • numactl/2.0.11
  • ocaml/4.06.0
  • oce/0.18.2
  • oce/0.18.3
  • oniguruma/6.1.3
  • opari2/2.0.4
  • openblas/0.2.20
  • opencv/3.4.3
  • openjdk/11.0.2
  • openjpeg/2.3.0
  • openmpi/2.1.1
  • openmpi/3.0.1
  • openssl/1.0.1e
  • otf2/2.2
  • pango/1.40.3
  • pango/1.41.0
  • papi/5.5.1
  • patch/2.7.6
  • patchelf/0.9
  • pbzip2/1.1.13
  • pcre/8.41
  • pcre2/10.20
  • pdt/3.22.1
  • perl-term-readkey/2.37
  • perl-xml-parser/2.44
  • perl/5.16.3
  • perl/5.24.1
  • pigz/2.4
  • pixman/0.34.0
  • pkg-config/0.29.2
  • pkgconf/1.4.0
  • plzip/1.6
  • poppler-data/0.4.9
  • poppler/0.65.0
  • portaudio/190600_20161030
  • postgresql/10.3
  • prank/170427
  • presentproto/1.0
  • printproto/1.0.5
  • proj/4.9.2
  • proj/5.2.0
  • protobuf/3.5.1.1
  • python/2.7.14
  • python/3.6.4
  • python/3.7.4
  • qhull/2015.2
  • qrupdate/1.1.2
  • qt/4.8.6
  • qt/5.9.1
  • qt/5.10.0
  • r/3.4.3
  • r/3.5.1
  • ragel/6.10
  • randrproto/1.5.0
  • raptor/2.0.15
  • rasqal/0.9.33
  • readline/7.0
  • renderproto/0.11.1
  • resourceproto/1.2.0
  • ruby/2.2.0
  • samtools/1.6
  • scala/2.12.1
  • scons/3.0.1
  • scotch/6.0.3
  • sdl2/2.0.5
  • sed/4.2.2
  • seqtk/1.2
  • serf/1.3.9
  • setxkbmap/1.3.1
  • sharc/2.1.1
  • shared-mime-info/1.8
  • silo/4.10.2
  • snappy/1.1.7
  • sos/1.4.3
  • sowing/1.1.23-p1
  • sparsehash/2.0.3
  • sqlite/3.22.0
  • sqlite/3.30.0
  • sra-toolkit/2.8.2-1
  • star/2.5.3a
  • sublime-text/2.0.2
  • subversion/1.9.7
  • suite-sparse/5.1.0
  • superlu/5.2.1
  • swig/2.0.12
  • swig/3.0.12
  • sz/1.4.12.3
  • tar/1.29
  • tcl/8.6.8
  • tetgen/1.5.0
  • texinfo/6.5
  • texlive/live
  • timidity/2.14.0
  • tk/8.6.8
  • tmux/2.6
  • tophat/2.1.2
  • tree/1.7.0
  • udunits2/2.2.24
  • units/2.13
  • unixodbc/2.3.4
  • unzip/6.0
  • util-linux/2.29.2
  • util-macros/1.19.1
  • valgrind/3.13.0
  • videoproto/2.3.3
  • vim/8.0.0503
  • vim/8.0.1376
  • vim/8.1.1746
  • wget/1.19.1
  • wildmidi/0.4.2
  • wx/3.1.0
  • wxwidgets/3.1.0
  • xauth/1.0.9
  • xbitmaps/1.1.1
  • xcb-proto/1.13
  • xcb-util-cursor/0.1.3
  • xcb-util-errors/1.0
  • xcb-util-image/0.4.0
  • xcb-util-keysyms/0.4.0
  • xcb-util-renderutil/0.3.9
  • xcb-util-wm/0.4.1
  • xcb-util/0.4.0
  • xerces-c/3.1.4
  • xextproto/7.3.0
  • xhost/1.0.7
  • xineramaproto/1.2.1
  • xkbcomp/1.3.1
  • xkbdata/1.0.1
  • xmgrace/5.1.25
  • xpdf/4.01.01
  • xproto/7.0.31
  • xtrans/1.3.5
  • xz/5.2.3
  • yasm/1.3.0
  • zeromq/4.2.2
  • zip/3.0
  • zlib/1.2.9
  • zlib/1.2.11
  • zsh/5.4.2
  • zstd/1.3.0

GCC 6.3.0

  • abseil-cpp/20190808
  • ack/2.22
  • alglib/3.11.0
  • alsa-lib/1.1.4.1
  • angsd/0.921
  • ant/1.9.9
  • antlr/2.7.7
  • apr-util/1.6.0
  • apr/1.6.2
  • aragorn/1.2.38
  • argtable/2-13
  • aspell/0.60.6.1
  • astral/4.10.7
  • astyle/3.0.1
  • atk/2.20.0
  • atk/2.21.90
  • atlas/3.10.2
  • atompaw/4.0.0.13
  • atop/2.2-3
  • autoconf/2.69
  • automake/1.15.1
  • bamtools/2.5.1
  • bash/4.4.12
  • bazel/0.11.1
  • bazel/0.24.1
  • bbmap/37.36
  • bc/1.07
  • bcftools/1.6
  • bdw-gc/7.6.0
  • beast1/1.8.4
  • beast2/2.4.6
  • bedtools2/2.27.1
  • berkeley-db/6.2.32
  • binutils/2.28
  • binutils/2.29.1
  • bison/3.0.4
  • bitmap/1.0.8
  • blat/35
  • blaze/3.2
  • blitz/1.0.1
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • bowtie/1.2
  • bowtie2/2.3.4.1
  • bpp-core/2.2.0
  • bpp-phyl/2.2.0
  • bpp-seq/2.2.0
  • bpp-suite/2.2.0
  • bwa/0.7.17
  • bzip2/1.0.6
  • c-blosc/1.12.1
  • cairo/1.14.10
  • cairo/1.14.12
  • cap3/2015-02-11
  • cares/1.13.0
  • cdbfasta/2017-03-16
  • cdhit/4.6.8
  • cereal/1.2.2
  • cgal/4.11
  • cloc/1.74
  • clustalo/1.2.4
  • clustalw/2.1
  • cmake/2.8.10.2
  • cmake/3.5.2
  • cmake/3.9.4
  • cmake/3.11.0
  • cmake/3.11.1
  • cmake/3.15.3
  • cmocka/1.1.1
  • colm/0.12.0
  • compositeproto/0.4.2
  • coreutils/8.26
  • cppad/20170000.8
  • cppcheck/1.81
  • cppunit/1.13.2
  • cscope/15.8b
  • cube/4.3.5
  • cuda/9.1.85
  • cudnn/6.0
  • cups/2.2.3
  • curl/7.59.0
  • cvs/1.12.13
  • czmq/4.0.2
  • damageproto/1.2.1
  • dante/1.4.2
  • datamash/1.1.0
  • dbus/1.11.2
  • dmd/2.081.1
  • dmxproto/2.3.1
  • dos2unix/7.3.4
  • double-conversion/2.0.1
  • dri2proto/2.8
  • dri3proto/1.0
  • ed/1.4
  • eigen/3.3.4
  • emacs/26.1
  • exonerate/2.4.0
  • expat/2.2.2
  • exuberant-ctags/5.8
  • farmhash/92e897
  • fastqc/0.11.5
  • fastx-toolkit/0.0.14
  • ffmpeg/3.2.4
  • fftw/3.3.5
  • findutils/4.6.0
  • fixesproto/5.0
  • flac/1.3.2
  • flash/1.2.11
  • flex/2.6.4
  • flint/2.5.2
  • fltk/1.3.3
  • fluidsynth/1.1.10
  • font-util/1.3.1
  • fontcacheproto/0.1.3
  • fontconfig/2.12.3
  • fontsproto/2.1.3
  • fonttosfnt/1.0.4
  • freetype/2.7.1
  • freexl/1.0.5
  • gatk/4.0.4.0
  • gawk/4.1.4
  • gdbm/1.14.1
  • gdk-pixbuf/2.31.2
  • gdk-pixbuf/2.31.3
  • gemmlowp/a6f29d9ac
  • geos/3.6.2
  • gettext/0.19.8.1
  • gflags/2.1.2
  • ghostscript-fonts/8.11
  • ghostscript/9.21
  • giflib/5.1.4
  • git-lfs/2.3.0
  • git/2.15.1
  • glew/2.0.0
  • glib/2.56.0
  • glm/0.9.7.1
  • global/6.5
  • glog/0.3.5
  • glpk/4.65
  • glproto/1.4.17
  • gmake/4.2.1
  • gmp/6.1.2
  • gnat/2016
  • gnuplot/5.2.0
  • gnutls/3.5.13
  • go-bootstrap/1.4-bootstrap-20171003
  • go/1.10.1
  • gobject-introspection/1.49.1
  • gobject-introspection/1.49.2
  • googletest/1.8.1
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  • util-linux/2.29.2
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  • wxwidgets/3.1.0
  • xauth/1.0.9
  • xbitmaps/1.1.1
  • xcb-proto/1.13
  • xcb-util-cursor/0.1.3
  • xcb-util-errors/1.0
  • xcb-util-image/0.4.0
  • xcb-util-keysyms/0.4.0
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  • xcb-util-wm/0.4.1
  • xcb-util/0.4.0
  • xerces-c/3.1.4
  • xextproto/7.3.0
  • xhost/1.0.7
  • xineramaproto/1.2.1
  • xkbcomp/1.3.1
  • xkbdata/1.0.1
  • xmgrace/5.1.25
  • xproto/7.0.31
  • xtrans/1.3.5
  • xz/5.2.3
  • yasm/1.3.0
  • zip/3.0
  • zlib/1.2.11
  • zsh/5.4.2
  • zstd/1.3.0

Intel 18.0.1

  • abaqus/2016
  • abaqus/2018
  • abseil-cpp/20190808
  • ack/2.22
  • alglib/3.11.0
  • alsa-lib/1.1.4.1
  • ant/1.9.9
  • antlr/2.7.7
  • apr-util/1.6.0
  • apr/1.6.2
  • aragorn/1.2.38
  • argtable/2-13
  • aspell/0.60.6.1
  • astral/4.10.7
  • astyle/3.0.1
  • atk/2.20.0
  • atk/2.21.90
  • atompaw/4.0.0.13
  • atop/2.2-3
  • autoconf/2.69
  • automake/1.15.1
  • bamtools/2.5.1
  • bamutil/1.0.13
  • bash/4.4.12
  • bbmap/37.36
  • bc/1.07
  • bcftools/1.6
  • bdw-gc/7.6.0
  • beast1/1.8.4
  • beast2/2.4.6
  • bedtools2/2.27.1
  • berkeley-db/6.2.32
  • binutils/2.28
  • binutils/2.29.1
  • bison/3.0.4
  • bitmap/1.0.8
  • blat/35
  • blaze/3.2
  • blitz/1.0.1
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • bowtie2/2.3.4.1
  • bpp-core/2.2.0
  • bpp-phyl/2.2.0
  • bpp-seq/2.2.0
  • bpp-suite/2.2.0
  • bwa/0.7.17
  • bzip2/1.0.6
  • c-blosc/1.12.1
  • cairo/1.14.10
  • cairo/1.14.12
  • cap3/2015-02-11
  • cares/1.13.0
  • cdbfasta/2017-03-16
  • cdhit/4.6.8
  • cereal/1.2.2
  • cgal/4.11
  • cloc/1.74
  • clustalo/1.2.4
  • clustalw/2.1
  • cmake/2.8.10.2
  • cmake/3.5.2
  • cmake/3.9.4
  • cmake/3.12.0
  • cmake/3.12.1
  • cmake/3.15.3
  • cmocka/1.1.1
  • colm/0.12.0
  • compositeproto/0.4.2
  • coreutils/8.26
  • cppad/20170000.8
  • cppcheck/1.81
  • cppunit/1.13.2
  • cscope/15.8b
  • cube/4.3.5
  • cvs/1.12.13
  • czmq/4.0.2
  • damageproto/1.2.1
  • dante/1.4.2
  • datamash/1.1.0
  • dbus/1.11.2
  • dmxproto/2.3.1
  • dos2unix/7.3.4
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  • dri3proto/1.0
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  • fastqc/0.11.5
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  • fftw/3.3.5
  • findutils/4.6.0
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  • font-util/1.3.1
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  • fontconfig/2.12.3
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  • freexl/1.0.5
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  • gdk-pixbuf/2.31.2
  • gdk-pixbuf/2.31.3
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  • gettext/0.19.8.1
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  • ghostscript/9.21
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  • glm/0.9.7.1
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  • go-bootstrap/1.4-bootstrap-20171003
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  • gobject-introspection/1.49.2
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  • gperftools/2.4
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  • harfbuzz/1.4.6
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  • htslib/1.7
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  • hwloc/2.0.1
  • hypre/2.13.0
  • icu4c/60.1
  • image-magick/7.0.5-9
  • imake/1.0.7
  • inputproto/2.3.2
  • intel-tbb/2018.2
  • intltool/0.51.0
  • isl/0.14
  • isl/0.15
  • isl/0.19
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  • jasper/1.900.1
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  • jemalloc/4.5.0
  • jmol/14.8.0
  • jq/1.5
  • jsoncpp/1.7.3
  • judy/1.0.5
  • kbproto/1.0.7
  • krb5/1.16.1
  • lcms/2.8
  • leveldb/1.20
  • lftp/4.8.1
  • libarchive/3.3.2
  • libatomic-ops/7.4.4
  • libbsd/0.8.6
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  • libctl/3.2.2
  • libdrm/2.4.81
  • libedit/3.1-20170329
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  • libevent/2.0.21
  • libfabric/1.8.0
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  • libfontenc/1.1.3
  • libfs/1.0.7
  • libgcrypt/1.8.1
  • libgd/2.2.4
  • libgme/0.6.2
  • libgpg-error/1.27
  • libgtextutils/0.7
  • libice/1.0.9
  • libiconv/1.15
  • libint/2.2.0
  • libjpeg-turbo/1.5.3
  • libjpeg/9c
  • libmng/2.0.3
  • libogg/1.3.2
  • libopenal/1.18.2
  • libpciaccess/0.13.5
  • libpipeline/1.4.2
  • libpng/1.6.34
  • libpthread-stubs/0.4
  • librdf/1.0.17
  • libsigsegv/2.11
  • libsm/1.2.2
  • libsodium/1.0.15
  • libsvm/322
  • libszip/2.1.1
  • libtiff/4.0.8
  • libtool/2.4.6
  • libunistring/0.9.7
  • libunwind/1.1
  • libvorbis/1.3.5
  • libx11/1.6.5
  • libxau/1.0.8
  • libxaw/1.0.13
  • libxc/2.2.2
  • libxc/3.0.0
  • libxcb/1.13
  • libxcomposite/0.4.4
  • libxdamage/1.1.4
  • libxdmcp/1.1.2
  • libxext/1.3.3
  • libxfixes/5.0.2
  • libxfont/1.5.2
  • libxft/2.3.2
  • libxi/1.7.6
  • libxinerama/1.1.3
  • libxkbcommon/0.8.0
  • libxkbfile/1.0.9
  • libxml2/2.9.4
  • libxmu/1.1.2
  • libxp/1.0.3
  • libxpm/3.5.12
  • libxrender/0.9.10
  • libxshmfence/1.2
  • libxslt/1.1.29
  • libxslt/1.1.30
  • libxsmm/1.13
  • libxt/1.1.5
  • libxv/1.0.10
  • libxvmc/1.0.9
  • lmdb/0.9.21
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  • lua-luaposix/33.4.0
  • lua/5.3.4
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  • lziprecover/1.19
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  • m4/1.4.18
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  • man-db/2.7.6.1
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  • mawk/1.3.4
  • mesa-glu/9.0.0
  • mesa/17.2.3
  • metis/5.1.0
  • mkfontdir/1.0.7
  • mkfontscale/1.1.2
  • mpc/1.1.0
  • mpfr/4.0.1
  • nasm/2.13.03
  • nco/4.6.7
  • ncurses/6.0
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  • openmpi/3.0.1
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  • otf2/2.2
  • pango/1.40.3
  • pango/1.41.0
  • papi/5.5.1
  • patch/2.7.6
  • patchelf/0.9
  • pbzip2/1.1.13
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  • pcre2/10.20
  • pdt/3.22.1
  • perl-term-readkey/2.37
  • perl-xml-parser/2.44
  • perl/5.24.1
  • pigz/2.4
  • pixman/0.34.0
  • pkg-config/0.29.2
  • pkgconf/1.4.0
  • plzip/1.6
  • poppler-data/0.4.9
  • poppler/0.65.0
  • portaudio/190600_20161030
  • postgresql/10.3
  • prank/170427
  • presentproto/1.0
  • printproto/1.0.5
  • proj/4.9.2
  • proj/5.2.0
  • protobuf/3.5.1.1
  • python/2.7.14
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  • qrupdate/1.1.2
  • qt/5.10.0
  • r/3.4.3
  • r/3.5.1
  • ragel/6.10
  • randrproto/1.5.0
  • raptor/2.0.15
  • rasqal/0.9.33
  • readline/7.0
  • renderproto/0.11.1
  • resourceproto/1.2.0
  • ruby/2.2.0
  • samtools/1.6
  • scala/2.12.1
  • scons/3.0.1
  • scotch/6.0.3
  • sdl2/2.0.5
  • sed/4.2.2
  • seqtk/1.2
  • setxkbmap/1.3.1
  • shared-mime-info/1.8
  • silo/4.10.2
  • snappy/1.1.7
  • sowing/1.1.23-p1
  • sparsehash/2.0.3
  • sqlite/3.22.0
  • sqlite/3.30.0
  • sra-toolkit/2.8.2-1
  • star/2.5.3a
  • sublime-text/2.0.2
  • suite-sparse/5.1.0
  • superlu/5.2.1
  • swig/2.0.12
  • swig/3.0.12
  • sz/1.4.12.3
  • tar/1.29
  • tcl/8.6.8
  • texinfo/6.5
  • texlive/live
  • tk/8.6.8
  • tmux/2.6
  • tophat/2.1.2
  • tree/1.7.0
  • udunits2/2.2.24
  • units/2.13
  • unixodbc/2.3.4
  • unzip/6.0
  • util-linux/2.29.2
  • util-macros/1.19.1
  • videoproto/2.3.3
  • vim/8.0.0503
  • vim/8.0.1376
  • vim/8.1.1746
  • wget/1.19.1
  • wildmidi/0.4.2
  • wx/3.1.0
  • wxwidgets/3.1.0
  • xauth/1.0.9
  • xbitmaps/1.1.1
  • xcb-proto/1.13
  • xcb-util-cursor/0.1.3
  • xcb-util-errors/1.0
  • xcb-util-image/0.4.0
  • xcb-util-keysyms/0.4.0
  • xcb-util-renderutil/0.3.9
  • xcb-util-wm/0.4.1
  • xcb-util/0.4.0
  • xerces-c/3.1.4
  • xextproto/7.3.0
  • xhost/1.0.7
  • xineramaproto/1.2.1
  • xkbcomp/1.3.1
  • xkbdata/1.0.1
  • xmgrace/5.1.25
  • xproto/7.0.31
  • xtrans/1.3.5
  • xz/5.2.3
  • yasm/1.3.0
  • zeromq/4.2.2
  • zip/3.0
  • zlib/1.2.11
  • zsh/5.4.2
  • zstd/1.3.0


MPI layer

The MPI layer contains modules that are depending on a particular compiler/MPI combination.

OpenMPI 3.0.1 GCC 4.8.5

  • ambertools/19
  • arpack-ng/3.5.0
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • dtcmp/1.1.0
  • fftw/3.3.7
  • foam-extend/3.2
  • foam-extend/4.0
  • gmsh/4.4.1
  • hdf5/1.10.1
  • hmmer/3.1b2
  • hypre/2.12.1
  • hypre/2.13.0
  • hypre/2.14.0
  • kahip/2.00
  • lammps/20190807
  • libcircle/0.2.1.-rc.1
  • lwgrp/1.0.2
  • matio/1.5.9
  • mdtest/1.9.3
  • mumps/5.1.1
  • netcdf-cxx4/4.3.0
  • netcdf-fortran/4.4.1
  • netcdf/4.4.1.1
  • netlib-scalapack/2.0.2
  • openfoam-com/1806
  • parallel-netcdf/1.8.0
  • parallel-netcdf/1.9.0
  • paraview/5.0.1
  • paraview/5.4.1
  • parmetis/4.0.3
  • parmgridgen/1.0
  • petsc/3.8.4
  • petsc/3.9.4
  • qbox/1.68.0
  • relion/3.0.7
  • scalasca/2.3.1
  • scorep/3.1
  • scotch/6.0.4
  • scotch/6.0.6
  • superlu-dist/4.3
  • superlu-dist/5.2.2
  • superlu-dist/6.1.1
  • trilinos/12.8.1
  • trilinos/12.10.1
  • trilinos/12.12.1
  • vtk/8.1.2
  • zoltan/3.83

OpenMPI 3.0.1 GCC 6.3.0

  • arpack-ng/3.5.0
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • dtcmp/1.1.0
  • fenics/2019.1.0
  • fftw/3.3.7
  • gmsh/4.4.1
  • hdf5/1.10.1
  • hmmer/3.1b2
  • hypre/2.12.1
  • hypre/2.13.0
  • hypre/2.14.0
  • kahip/2.00
  • libcircle/0.2.1.-rc.1
  • lwgrp/1.0.2
  • matio/1.5.9
  • mdtest/1.9.3
  • mumps/5.1.1
  • netcdf-cxx4/4.3.0
  • netcdf-fortran/4.4.1
  • netcdf/4.4.1.1
  • netlib-scalapack/2.0.2
  • parallel-netcdf/1.8.0
  • parallel-netcdf/1.9.0
  • parmetis/4.0.3
  • parmgridgen/1.0
  • petsc/3.8.4
  • petsc/3.9.4
  • relion/3.0.7
  • scalasca/2.3.1
  • scorep/3.1
  • scotch/6.0.4
  • scotch/6.0.6
  • superlu-dist/4.3
  • superlu-dist/5.2.2
  • superlu-dist/6.1.1
  • trilinos/12.8.1
  • trilinos/12.10.1
  • trilinos/12.12.1
  • vtk/8.1.2
  • zoltan/3.83

OpenMPI 3.0.1 GCC 8.2.0

  • arpack-ng/3.5.0
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • dtcmp/1.1.0
  • fftw/3.3.7
  • foam-extend/4.0
  • gmsh/4.4.1
  • hdf5/1.10.1
  • hmmer/3.1b2
  • hypre/2.12.1
  • hypre/2.13.0
  • hypre/2.14.0
  • kahip/2.00
  • libcircle/0.2.1.-rc.1
  • lwgrp/1.0.2
  • matio/1.5.9
  • mdtest/1.9.3
  • mumps/5.1.1
  • netcdf-cxx4/4.3.0
  • netcdf/4.4.1.1
  • netlib-scalapack/2.0.2
  • openfoam-com/1806
  • parallel-netcdf/1.8.0
  • parallel-netcdf/1.9.0
  • paraview/5.4.1
  • parmetis/4.0.3
  • parmgridgen/1.0
  • petsc/3.8.4
  • petsc/3.9.4
  • relion/3.0.7
  • scalasca/2.3.1
  • scotch/6.0.4
  • scotch/6.0.6
  • superlu-dist/4.3
  • superlu-dist/5.2.2
  • superlu-dist/6.1.1
  • trilinos/12.8.1
  • trilinos/12.10.1
  • trilinos/12.12.1
  • vtk/8.1.2
  • zoltan/3.83

OpenMPI 3.0.1 Intel 18.0.1

  • arpack-ng/3.5.0
  • boost/1.66.0
  • boost/1.68.0
  • dtcmp/1.1.0
  • fftw/3.3.7
  • gmsh/4.4.1
  • hdf5/1.10.1
  • hmmer/3.1b2
  • hypre/2.12.1
  • hypre/2.13.0
  • libcircle/0.2.1.-rc.1
  • lwgrp/1.0.2
  • matio/1.5.9
  • mdtest/1.9.3
  • mumps/5.1.1
  • netcdf-cxx4/4.3.0
  • netcdf-fortran/4.4.1
  • netcdf/4.4.1.1
  • netlib-scalapack/2.0.2
  • parallel-netcdf/1.8.0
  • parallel-netcdf/1.9.0
  • parmetis/4.0.3
  • parmgridgen/1.0
  • relion/3.0.7
  • scalasca/2.3.1
  • scorep/3.1
  • scotch/6.0.4
  • scotch/6.0.6
  • superlu-dist/4.3
  • superlu-dist/5.2.2
  • superlu-dist/6.1.1

MPICH 3.3.1 GCC 4.8.5

  • boost/1.66.0
  • fftw/3.3.7
  • hdf5/1.10.1
  • netcdf-fortran/4.4.1
  • netcdf/4.4.1.1
  • parallel-netcdf/1.8.0
  • spyking_circus/0.8.4